Странно, должно меняться. Кстати, если везде, где встречается такая комбинация slax.flags=perch,xmode заменить её на slax.flags=xmode,toram - выставленные птички "сохранить настройки" и "графический режим" на самом деле должны работать , как "загрузить в память" и "графический режим" (Это теоретически, проверить сейчас не могу)